文章目录

1 资料与方法

1.1 数据库及软件资源

1.2 方法

    1.2.1 枸杞子有效成分筛选和靶点预测：

    1.2.2 枸杞子有效成分作用靶点的基因名一致化：

    1.2.3 枸杞子有效成分与作用靶点网络图：

    1.2.4 寻找骨质疏松疾病靶点：

    1.2.5 “枸杞子-骨质疏松”药物疾病交集靶点对应的有效成分：

    1.2.6 构建交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络：

    1.2.7 “枸杞子-骨质疏松”核心靶点基因筛选：

1.3 GO和KEGG分析

2 结果

2.1 枸杞子主要有效成分筛选结果

2.2 枸杞子靶点基因与骨质疏松疾病基因交集

2.3 PPI网络图构建及核心基因筛选

2.4 GO功能富集分析

2.5 KEGG信号通路富集分析

3 讨论

文章摘要:目的运用网络药理学方法分析枸杞子治疗骨质疏松症的药理学机制。方法从TCMSP分析平台上获取枸杞子药物的活性成分及潜在的作用靶点,运用Citespace3.7.1软件绘制"有效成分-靶点"网络图;同时分别在OMIM、Drugbank和Genecards三种数据库平台上获取骨质疏松疾病的相关基因,并取并集作为疾病的潜在作用靶点。将枸杞子和骨质疏松疾病的潜在作用靶点取交集,得到中药-疾病共同作用靶点。运用STRING数据分析平台对共同作用靶点进行PPI网络分析,利用cytohubba插件选取前20位显著性基因并取交集即可得到核心基因。对核心靶点进行GO功能和KEGG通路富分析,而后使用R语言软件对上述的富集结果进行可视化绘图。结果共筛选获得枸杞子中主要有效成分36个,其中主要核心有效成分有槲皮素、黄豆黄素、β-谷固醇、豆甾醇、谷甾醇α1。活性成分所对应的靶点基因有117个,其中核心基因16个:IL-6、JUN、TNF等。GO富集所得的生物过程主要与调控成骨细胞和破骨细胞的增殖、分化有关。KEGG信号通路富集结果提示,枸杞子治疗骨质疏松疾病作用集中于IL-17、TNF、AGE-RAGE、MAPK等信号通路。结论枸杞子可能通过多种有效成分、多靶点作用于免疫炎性反应、细胞分化等多方面来发挥抗骨质疏松症的作用。

文章关键词:

项目基金:《牡丹江大学学报》 网址: http://www.mdjdxxb.cn/qikandaodu/2021/1214/930.html